微小RNA（miRNA）是一类在基因表达调控中发挥关键作用的非编码RNA，广泛参与从肿瘤发生到病毒感染等多种病理过程。得益于可与核糖核蛋白复合物或细胞外囊泡结合，miRNA能在血浆、血清等体液中稳定存在，因而被视为疾病诊断、预后及疗效监测的理想标志物。尽管近年来已有大量关于miRNA作为生物标志物的研究报道，但成功转化为临床应用的产品却十分有限。这主要源于miRNA存在的诸多固有挑战，包括其序列极短（仅约22 nt），家族成员序列高度同源，体液中丰度极低，同时样本中存在复杂基质干扰。而传统的miRNA检测方法（如茎环法qRT-PCR）往往存在灵敏度不足、特异性欠佳等问题，严重制约了miRNA在临床精准诊断中的推广应用。

针对传统miRNA检测方法的不足，实验室自主开发了一种名为选择性富集与探针特异性末端介导的茎环qPCR（SE-SPTM-PCR）的新型检测平台（图1）。该平台对从样本提取到miRNA检测的全流程进行了重构，其核心创新在于“选择性富集”与“特异性识别”两大技术模块的协同整合。在富集阶段，利用磁珠偶联的特异性探针精准捕获目标miRNA，实现了极低丰度分子的高效富集与纯化；在识别阶段，通过在TaqMan探针的3’端引入特异性识别序列并精细调控引物和探针长度，在排除非特异性扩增、维持高效扩增的同时，实现了对单碱基差异miRNA的精确区分。与传统检测方案（吸附柱提取+茎环法qRT-PCR）相比，SE-SPTM-PCR平台的检测灵敏度提升了约100倍，最低检测限低至10^3拷贝/mL，在健康人血浆等复杂基质样本中表现出极强的抗干扰能力。

图1. SE-SPTM-PCR平台示意图

该平台的临床应用价值在三种疾病模型中得到了充分验证。在结直肠癌诊断中，与两种传统检测方案相比，SE-SPTM-PCR显著提升了部分已知人源miRNA的诊断效能，其中hsa-miR-92a-3p的AUC从0.72提升至0.85。在造血干细胞移植后HCMV再激活诊断中，该平台精准检测了此前被认为无诊断价值的hcmv-miR-UL22A-5p，成功区分HCMV DNA阳性与阴性患者，AUC高达0.95。在鼻咽癌诊断中，针对此前也被认为无诊断价值的ebv-miR-BART3-3p等三种EBV miRNA，传统方案检测虽有统计学差异但区分能力有限；而SE-SPTM-PCR有效排除了健康人群的非特异性信号干扰，实现了健康人与鼻咽癌患者的完全区分，三种miRNA的AUC均达到1.0。

综上所述，SE-SPTM-PCR平台通过“富集+识别”双重保障机制，为miRNA液体活检提供了一种高灵敏度和高特异性的理想工具。该平台不仅显著提升了已知标志物的诊断效能，更有望重新发掘被忽视的miRNA的临床价值，为疾病早期筛查、诊断和疗效监测开辟了新的路径。

近日，该研究成果以题为“A selective enrichment and specific probe terminal mediated strategy for highly sensitive detection of microRNAs”的研究论文在线发表于《自然·通讯》（Nature Communications）。实验室钟泽澄、黄伟达、葛仡，福建医科大学附属第一医院任金华，中山大学肿瘤防治中心袁莉、厦门市海沧医院钟秋蓉为该论文的共同第一作者。实验室夏宁邵、张师音、葛胜祥，福建医科大学附属第一医院杨婷，中山大学肿瘤防治中心唐林泉，厦门市海沧医院何水珍为该论文的共同通讯作者。该研究得到了国家重点研发计划、福建省卫生健康委员会医学科研计划、福建省自然科学基金、厦门市自然科学基金、中央高校基本科研业务费专项、传染病疫苗研发全国重点实验室开放课题、传染病疫苗研发全国重点实验室自主研究项目的资助与支持。

论文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-026-70811-7